Danganronpa Another Episode: Ultra Despair Girls è ambientato tra i due capitoli precedenti: Danganronpa: Trigger Happy Havoc e Danganronpa 2: Goodbye Despair. Si tratta di un action in cui il giocatore deve superare diverse sequenze, alcune con enigmi e puzzle, per riuscire a fuggire da una città infestata da orsetti malefici chiamati Monokumas. La protagonista del gioco è Komaru Naegi, già vista nel primo capitolo.