Il ragazzo desiderava proteggere la ragazza. Era quello il suo intento. A distanza di soli 10 anni dalla precedente Guerra del Santo Graal ⿿ una battaglia condotta da maghi (Master) e Spiriti Eroici (Servant) al solo scopo di ottenere il leggendario calice onnipotente in grado di realizzare ogni desiderio ⿿ una nuova guerra incombe sulla città di Fuyuki. Emiya Shirou, figlio adottivo di Emiya Kiritsugu che partecipò alla precedente Guerra, ha deciso di combattere per realizzare l⿿ideale del defunto padre. Insieme a Saber, il Servant da lui evocato, Shirou forma un⿿alleanza con Tohsaka Rin e prende parte alla Guerra del Santo Graal. Ma la battaglia inizierà a degenerare non appena strategie segrete verranno messe in atto da forze invisibili.